我国栽培的花椒品种繁多，全国约有60多种，名称各异，甚至有同种异名和同名异种的现象。名称的叫法，有的以产地来分，如“秦椒”、“蜀椒”，四川还有“汉源椒”、“金阳椒”。有的按地区分布称，如“西路花椒”、“南路花椒”、野花椒”等。有的以叶形分，如“竹叶椒”。有的以果皮颜色分，如“青椒”、“大红袍”、“高脚黄”等。有的以气味来分，如“臭椒”。有的以成熟季节分，如“伏椒”、“秋椒”等等各地命名不规范。
关于花椒的常规栽培品种，四川汉源县王明钊、甘肃省王世吉等有过论著，目前还缺乏植物分类学方面的研究。这里就几个主栽品种予以简介，便于各地生产者识别，以因地制宜地选留、引进和推广花椒良种，提高经济效益。
一、正路花椒又叫南路花椒，古称“蜀椒”，《齐民要术》曰：“蜀椒出武都”，解放后宜宾、乐山、内江、重庆、涪陵、丰都等地也有引种栽培品种特征：正路花椒树高中等，树势强健，树冠伸张，枝条短而密。聚伞状圆锥花序，腋生或顶生。全树多皮刺，树干褐色，嫩枝紫绿。单数羽状复叶，小叶连生，一般5一11片，无柄，纸质，似披针形，叶缘锯齿不明显，在锯齿基部有一粒半透明圆形腺体。叶轴多有小刺。子房无柄或短柄果实成熟时瞢荧果呈紫红色，粒大籽红肉厚内果皮薄，果皮外芳香油腺体突起而密集呈半透明。每花序可平均结花椒果实70粒左右。果实麻味素含量多，油质重，香气浓郁，商品质量较佳，仅次于“清椒”
二、大红袍又名西路椒，古称“秦椒”，《齐民要术》日：“秦椒出天水”，主产于秦岭山脉的天水、陇西、陇南一带。陕西称“凤椒”，且是甘肃的主栽品种。在四川叫“小路椒”，主产平武、青川、汶川、茂汶（又叫茂椒）、金川、北川等地。
大红袍树高中等，树皮褐色，嫩枝绿红。特点是树冠较大，分枝少而直立，皮刺少而大，并随树的增大而减少。羽状复叶较大，小叶多，一般5一13片，叶薄无刺毛。聚伞状圆锥花序，顶生或腋生。果实成熟时，与正路花椒不同点是瞢英果呈鲜红色，故名“大红袍”，果实粒大而均匀，果肉较厚，腺体稀而大，油多味麻，品质上等。大红袍适应性强，丰产性好，但抗逆性较差，易产生“红山”（大年）、“黑山”（小年）现象。它性喜光照，适于在温凉、半干燥气候条件下和在排水良好的中性或微酸性土壤中栽培，是四川、甘肃、陕西的主要发展品种。
三、贡搬四川叫“清椒”，又名“黎椒”。因其花椒果实常并蒂12附生1一2粒未授粉的小红椒，似子母连蒂，故又名“子母椒娃娃椒”，很好识别。也是四川省涪陵市1万亩花椒基地引进的主要栽培品种。贡椒是正路花椒的一个实生苗变异品种，在四川主产于汉源清溪区，并以该区建黎乡牛市坡栽培的品质最好，故称清椒”和“黎椒”。近年来各地都有引种试栽，反应效果很好。在涪陵海拔米以上的牛坪坝山区，其树势和挂果都较理想。在甘肃陇南各县亦有大量种植，而以武都的洛塘区栽培品质最好。
贡椒在汉源等地种性比较稳定，且早熟、丰产性好、抗逆性强、适应性广。实生苗一般2-3年开花结果，5一6年进入盛果青龄期，7一8年进入丰产稳产的壮龄期，成年树单株可产干花椒5公斤左右。果实干制率高，空壳率也高。果实粒大肉厚，油重色丹红，芳香浓郁，醇麻适口，风味好，品质最优，居全国之冠。该品种古时作皇宫帝王及朝庭王公贵族的佳肴调料，故称“贡椒”，现在是各地推广的较理想的良种。贡椒由于花粉黏性特别强，不易从花药脱离而传粉受精，使花椒开花后常有不受精的小粒无核椒。在栽植中如品种单一、授粉不良，则子母椒多，影响产量。故在主栽贡椒的花椒园要多配植其它品种，多种野花椒、竹叶椒作授粉“公树”，以提高产量。
贡椒性喜光照，当气候温凉干燥、土质排水良好，pH值为中性或微碱性时，生长发育良好。四川大部分地区气候温和湿润，川东地区属亚热带湿润季风气候区，土质多酸性，而石灰岩质土壤黏性重，因此，过去曾在汉源县等地引种清椒的实生苗栽培，常变异性较大。今后在引种栽培中除注意生态环境外，一是采取适宜的栽培技术；二是选择有清椒代表性的母树，釆取嫁接苗和枝条繁殖苗进行种植y三是在采种母树的一定范围内，去除异种“公树”，以克服变异大的缺点，扩大种植推广面积。
四、竹叶椒又名狗屎椒、藤藤椒。分布于川西南和川东丘陵、山区的灌木林和荒坡，是一野生花椒品种。因其叶形似竹叶，故此得名。竹叶椒枝直而扩展，生长势强，有如藤条。皮刺多而大，基部扁平，随树龄增长而木栓化。花器发育不全，聚伞状圆锥花序腋生，小花多，开花后落叶落果都严重，成熟时只剩下少量果实，采收不慎，也易脱落，故产量不高，蓓荧果成熟时呈紫绿色，而果面具有一层蜡质，故称狗屎椒。果实腺体小而稀，香气淡而臭味大，麻味少，果肉薄，内果皮厚，食用价值低，商品质量差。
竹叶椒的优点在于生长势旺，耐瘠薄，抗病虫，是嫁接繁殖的优良砧木。它开花时花粉黏性不强，易随风传播，可提高其它品种的授粉率，从而提高产量，而且对被授粉的花椒果实，其商品质量无不良影响，可作授粉“公树”栽培。花椒的栽培品种繁多，如高脚黄，又名臭椒，不但是嫁接的好砧木，也是授粉的好“公树”，又如四川金阳花椒等等这些都是进行花椒良种选育的好材料，这里就不一一赞述了
